2009年，宁夏医科大学理学院正式组建。整合数学、物理、计算机等学科师资，主要承担全校数学、物理、计算机等公共基础课教学；同年设立各教研室，并首次招收“电子信息科学与技术”本科专业学生。

2016年，推进实验室条件升级，深化医工交叉教学改革。

2020年，获批“医学信息工程”本科专业，学院发展向医学信息化方向全面转型。

2023年4月，理学院正式更名为“医学信息与工程学院”，学院聚焦医学信息、医疗大数据、医学人工智能及医学工程等领域的人才培养，并大力推进实训平台与交叉课程建设。