行政机构：

学院办公室

学生工作办公室

师资队伍建设与教育教学管理中心

学科建设与科学研究管理中心

教学机构：

药学系

中药学系

临床药学系

科研机构：

六盘山区域药用资源保护与开发利用教育部重点实验室

宁夏特色中医药省部共建协同创新中心

宁夏特色中医药现代化工程技术研究中心

宁夏医药研究所

宁夏特色中医药协同创新中心

宁夏药物创制与仿制药研究重点实验室

教辅机构：

药学实验教学中心