2025年7月25日,我校袁玲教授课题组在《Phytomedicine》期刊(影响因子8.3,中国科学院1区,Top期刊)发表题为“Predicting the molecular mechanism of ginger targeting PRMT1/BTG2 axis to inhibit gastric cancer based on WGCNA and machine algorithms”的研究论文。该研究揭示了PRMT1可作为生姜抗胃癌作用的生物标志物,并表明生姜可通过靶向PRMT1/BTG2轴发挥抗胃癌作用。研究成果为解析生姜抗胃癌的药理机制提供了新视角,为胃癌的靶向治疗发掘了潜在新靶点,也为系统阐明生姜多靶点抗癌作用机制提供了优先研究路径。

(图1:文章首页截图)
本研究以药食同源中药生姜为对象,聚焦其防治胃癌的潜在机制,综合运用网络药理学、加权基因共表达网络分析(WGCNA)及机器学习算法,筛选生姜防治胃癌的关键生物标志物,并进一步解析与其构成信号轴的上游转录因子与下游信号蛋白,进而预测生姜干预胃癌的可能作用机制。本研究通过公共数据库获取生姜的活性成分及其作用靶点,结合疾病相关数据库及GEO数据库中的胃癌数据,利用WGCNA筛选胃癌相关靶点,取胃癌与生姜作用靶点的交集,获得潜在核心靶点。随后,采用多种机器学习算法对核心靶点进行筛选,确定核心靶点PRMT1,并对其开展临床相关性分析、基因突变特征、表观遗传调控、免疫浸润分析及分子结合验证。进一步通过数据库预测其上游转录因子EGR1及下游信号蛋白BTG2。本研究结果表明,PRMT1可作为生姜干预胃癌的潜在生物标志物,基于网络药理学、WGCNA与机器学习的整合分析,推测生姜可能通过调控PRMT1/BTG2信号轴发挥抗肿瘤作用,为解析生姜防治胃癌的药理机制提供了新的理论依据。

(图2:基于WGCNA和机器学习算法研究生姜靶向PRMT1/BTG2轴抑制胃癌)
A:生姜抗胃癌的核心靶点筛选;B:核心靶点PRMT1临床相关性研究;C:PRMT1与上游转录因子EGR1及下游信号蛋白BTG2相关性研究
袁玲教授为文章通讯作者,南一教授为共同通讯作者,陈国庆为第一作者,该项研究受到宁夏自然科学基金(No.2023AAC03222)、宁夏留学回国人员创新创业项目(宁人社函〔2024〕4号)的资助。
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.phymed.2025.156892