宁夏医科大学医学微生物学、人体寄生虫学教研室均于1958年建校时成立，1983年成立宁夏医学免疫学研究室，2002年医学微生物学教研室与免疫学研究室合并，更名为医学微生物学与免疫学教研室，2006年5月医学微生物学与免疫学教研室与人体寄生虫学教研室合并，称为病原生物学与医学免疫学教研室。经过半个多世纪的努力，教研室已成为区内较有影响力的教学与科研单位，并于2009年更名为病原生物学与医学免疫学系，病原生物学为校级重点学科。

本系现有专职教师20人，兼职教师3人，高级实验师1人，其中教授8人，副教授8人，讲师5人。具有博士学位的有15人，硕士学位4人，海外引进教授1人（学校二类人才引进），具有留学经历的教师7人，硕士生导师13人。学系现有病原生物学、免疫学和微生物学三个硕士学位授予点。已培养硕士生80名，在读硕士研究生19名。

人才培养方面，本系承担着校内各二级学院不同专业层次学生的《医学微生物学》、《医学免疫学》、《医学寄生虫学》、《感染与免疫学》、《医学微生物与免疫学》、《病原生物学概论与医学免疫学》、《微生物学》、《发酵工程》等多门课程，并为本科生开设了《临床免疫学》《精神免疫学》、《生殖免疫学》等选修课，为本科留学生开设了《医学微生物学》、《医学免疫学》、《人体寄生虫学》三门课，为硕士研究生开设了《细胞与分子免疫学》、《高级医学微生物学》、《免疫学实验技术》等课程, 为博士研究生开设了《细胞与分子免疫学》。全系教师积极参与教学改革研究，成果斐然，近5年获得宁夏区级教学成果1项和校级教学成果3项，现有区级精品课程2门和校级精品课程1门。主编/参编/统编教材20多部，编写的实验指导与辅导教材全部投入使用。承担区级教学研究项目3项、校级教学研究项目6项。在高等医学教育等核心期刊发表教改研究论文10余篇。

在科学研究方面，我系已经形成了两个稳定的研究方向：感染与免疫、肿瘤免疫。近5年获得各级科研课题60余项（其中国际资助项目3项，国内自然科学基金20项），各类科研经费总额1400余万元，已经发表科研论文100余篇，其中SCI收录30余篇。